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三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)作为乳腺癌的一种亚型约占乳腺癌的10%-15%,相较于乳腺癌的其他类型三阴性乳腺癌表现出更强的侵袭性和转移能力。大量研究都提示TGF-β/Smad信号通路的异常活化与三阴性乳腺癌的发生发展密切相关,尤其是在侵袭转移过程中发挥重要作用。除了诱导乳腺癌细胞的上皮-间质转化(Epithelial-Mesenchymal Transition,EMT)的途径之外,TGF-β/Smad信号通路还能促进翻译抑制蛋白4E-BP1的表达,4E-BP1可以竞争性结合真核翻译起始因子eIF4E,藉此TGF-β/Smad信号通路的异常激活也参与了对基因转录后翻译的调控。
11月22日,EMBO J在线发表了苏州大学周翊峰团队的研究成果:Micropeptide CIP2A-BP encoded by LINC00665 inhibits triple-negative breast cancer progression。研究发现了由lncRNA LINC00665编码的小肽CIP2A-BP在三阴性乳腺癌中被TGF-β/Smad通路抑制,与肿瘤进展密切相关。
周翊峰实验室在长期的长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)的研究中发现一些LncRNA可能具有一定的编码潜能。基于以上的认识,他们分析了TGF-β处理前后MCF-10A细胞系的Ribo-seq和RNA-seq数据,并结合进一步的多聚核糖体分析和qPCR的验证,筛选出转录组水平无显著差异,但在翻译组水平有显著差异的LINC00665。通过检测了苏州和广州两个独立临床中心的TNBC样本后,发现由LINC00665编码的小肽与TNBC的预后不良有关。
在随后的机制研究中,通过免疫共沉淀-质谱鉴定等方法发现了该小肽可以与CIP2A结合,该小肽取名为CIP2A-BP(CIP2A Binding Peptide)。CIP2A是PP2A的内源性抑制剂,PP2A在与CIP2A结合后酶活性下降。但CIP2A-BP可以竞争性的结合CIP2A,使之不能与PP2A的B56γ亚基结合,PP2A的活性因此增强,进而可以抑制PI3K/AKT/NFκB信号通路的激活,影响下游MMP2、MMP9 和Snail等基因的表达,以此参与了TNBC的转移和侵袭。